长期分居的如何办理离婚手续要看双方选择何种方式离婚。
如果选择诉讼的方式离婚的，需要下列手续：
（一）一方写好起诉状然后向被告住所地或者经常居住地的提起离婚诉讼。
（二）起诉之后会进行审查，会在七日之内绝对是否立案，对于符合立案条件的，会立案受理，并向被告送达起诉状，然后被告要进行答辩。
（三）接下来原告收到的立案通知后要交纳诉讼费。
（四）进行调解，如果在庭前调解的环节调解成功了，则不再安排开庭审理。
（五）调解失败的安排开庭审理。
（六）经过审理后认定夫妻感情已经破裂的就会判决准予离婚，反之就会判决不准离婚。
如果双方都同意离婚的，选择了协议离婚的方式离婚的，需要下列手续：
（一）双方就离婚问题达成一致，并就财产分割、子女抚养等问题协商好，并写一份离婚协议书。
（二）双方亲自到一方住所地的婚姻登记机关提出离婚申请。
（三）经过离婚冷静期。婚姻登记机关收到离婚登记申请之日起三十日内，任何一方不愿意离婚的，可以向婚姻登记机关撤回离婚登记申请，这就是离婚冷静期。
（四）三十天后，双方应当亲自到婚姻登记机关申请发给离婚证；未申请的，视为撤回离婚登记申请。
（五）婚姻登记机关查明双方确实是自愿离婚，并已经对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的，予以登记，发给离婚证。
【法律依据】
《民法典》第一千零七十六条，夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。